È possibile ricaricare l'e:Ny1 durante la notte sul vialetto o mentre si è in viaggio. Sono disponibili diverse opzioni di ricarica.
Quando si utilizza una stazione di ricarica rapida a corrente continua (CC) da 100 kW collegata alla porta di ricarica rapida CCS (Combined Charging System) dell'auto, la potente ma compatta batteria da 68,8 kWh dell'e:Ny1 può incamerare l'energia per 100 km di autonomia in soli 11 minuti e ricaricarsi dal 10% all'80% in circa 45 minuti.
Quando si utilizza una stazione di ricarica pubblica a corrente alternata possono essere necessarie circa 6 ore per caricare la batteria da 68 kWh dal 10% all'80% utilizzando il caricabatterie integrato da 11 kW.
Con l'app My Honda+ è possibile controllare quanta carica è rimasta nell'e:Ny1, impostare un programma di ricarica regolare e accedere ad altre statistiche, tutto tramite smartphone.